比利時的海關(guān)監(jiān)管辦法與歐盟其他國家一致。為了簡化單證便利貿(mào)易，并使海關(guān)數(shù)據(jù)電腦化，歐盟頒布了一項統(tǒng)一規(guī)定。自1998年1月1日起，出口、轉(zhuǎn)口和進口的海關(guān)申報統(tǒng)一使用“統(tǒng)一管理單證文本”（The Single Administrative Document，簡稱SAD）。SAD代替了以前由不同成員國簽發(fā)的用于確認出口、進口和轉(zhuǎn)口商品的大量文件。文中包含了一切按歐盟有關(guān)法規(guī)規(guī)定統(tǒng)一標準的所有信息。

在比利時任何一個海關(guān)辦公室都可通過SADBEL系統(tǒng)進行信息加工。此系統(tǒng)有一個重要特點，即報關(guān)信息可以直接從報關(guān)人的廠房或倉庫傳輸?shù)胶ｊP(guān)的計算機上。SAD也適用于歐盟與歐洲自由貿(mào)易聯(lián)盟國家（EFTA）的清關(guān)業(yè)務。對于鐵路運輸CIM（鐵路貨運國際協(xié)議）單據(jù)文本可以替代SAD文本（手續(xù)更加簡便）。公路運輸則采用TIR網(wǎng)絡，即國際公路運輸服務協(xié)議進行歐盟內(nèi)外貨物運輸業(yè)務。大多數(shù)西歐國家和一些中、東歐國家利用這一協(xié)議。

為了便利貿(mào)易，比利時海關(guān)簡化通關(guān)手續(xù)，根據(jù)新的海關(guān)規(guī)定，從歐盟之外進口的貨物可以直接運到進口工廠的庫內(nèi)清關(guān)。同樣，出口貨物也可以在工廠廠房內(nèi)進行報關(guān)。在此情況下，發(fā)票或發(fā)貨單即可替代正式的海關(guān)單據(jù)。凡是附合條件的公司可以得到授權(quán)享受上述優(yōu)惠。這使進出口企業(yè)節(jié)省了大量時間，使進出口手續(xù)簡化到最低限度。

在比利時設立的眾多分銷公司在海關(guān)授權(quán)下，可使用簡化程序報關(guān)。比利時擁有各類海關(guān)倉庫，其中私人倉庫最適合分撥、分銷。如果貨物寄存在私人倉庫中，既不需交納海關(guān)關(guān)稅，也不需交納增值稅和消費稅。但在私人倉庫存放的貨物，須由海關(guān)批準，商品代碼和貨值須在存放時予以申報。貨物出庫時可以采用簡化手續(xù)辦理清關(guān)業(yè)務。

此外，對于來料加工，可以申請免稅。免稅方式有兩種：一是暫不支付方式，即在進口時暫不支付關(guān)稅和增值稅，保證在一定期限內(nèi)把加工過的產(chǎn)品再出口。二是退稅方式，在進口時先繳納關(guān)稅和增值稅，在加工產(chǎn)品再出口時可申請退關(guān)稅，增值稅則通過支付??抵扣會計制度自動免除。海關(guān)對加工過程的監(jiān)管和系統(tǒng)的運行可以通過企業(yè)的會計記錄進行。因此，享有授權(quán)的廠商每季度需向海關(guān)報送履行貨單。

比利時對部分進出口貨物實行許可證制度。需要進口許可證的是一些產(chǎn)地不明和列入專門清單的貨物，需要出口許可證的是一些戰(zhàn)略性物資和專門列入清單的貨物。