牧野區(qū)原名郊區(qū)，建區(qū)于1955年，于2004年2月區(qū)劃調(diào)整后更名

2000年，郊區(qū)轄1個鎮(zhèn)、2個鄉(xiāng)。根據(jù)第五次人口普查數(shù)據(jù)，全區(qū)總人口141856人，其中：王村鎮(zhèn)30467平原鄉(xiāng)53705牧野鄉(xiāng)57684

2003年12月25日，國務院批準（國函[2003]134號）：郊區(qū)更名為牧野區(qū)。將紅旗區(qū)的東干道、北干道、榮校路、花園4個街道和原新華區(qū)的新輝路、衛(wèi)北2個街道劃歸牧野區(qū)管轄；將新鄉(xiāng)縣洪門鎮(zhèn)的定國、呂村、堡上、孫村、東聶莊、秦莊6個村劃歸牧野區(qū)管轄。將原郊區(qū)平原鄉(xiāng)的孟營一村、孟營二村、孟營三村、城關、東關、駱駝灣、馬小營、張莊、段村、留莊營、飲馬口、西馬小營、臧營13個村劃歸紅旗區(qū)管轄。將原郊區(qū)的平原鄉(xiāng)（不含孟營一村、孟營二村、孟營三村、城關、東關、駱駝灣、馬小營、張莊、段村、留莊營、飲馬口、西馬小營、臧營13個村）劃歸衛(wèi)濱區(qū)管轄。調(diào)整后，牧野區(qū)轄和平路、東干道、北干道、榮校路、花園、新輝路、衛(wèi)北7個街道和王村鎮(zhèn)、牧野鄉(xiāng)。區(qū)人民政府駐學院路。

2004年，全區(qū)轄王村鎮(zhèn)、牧野鄉(xiāng)2個鄉(xiāng)（鎮(zhèn)）和東干道、北干道、花園、榮校路、新輝路、衛(wèi)北、和平路7個街道辦事處，共57個行政村和34個社區(qū)居委會。轄區(qū)總面積93平方千米，總人口29.5萬人，其中非農(nóng)業(yè)人口22.26萬人，農(nóng)業(yè)人口7.26萬人。

截至2005年12月31日，牧野區(qū)轄7個街道、1個鎮(zhèn)、1個鄉(xiāng)：新輝路街道、衛(wèi)北街道、榮校路街道、北干道街道、東干道街道、花園街道、和平路街道；王村鎮(zhèn)；牧野鄉(xiāng)。